苍术在合理辨证、规范使用的情况下，一般不会对肝肾造成损伤；但如果长期过量服用、辨证不当或体质不适合，则可能间接给肝肾带来负担，甚至产生潜在影响。
苍术为菊科植物茅苍术或北苍术的干燥根茎，现代药理学研究发现其含有的苍术醇等成分有一定保肝作用，因此在合理应用的情况下有助于预防肝细胞损害，还有助于促进肝脏蛋白质合成。
但是，苍术含有的挥发油等活性成分，进入人体后需经肝脏代谢分解、肾脏过滤排泄，若长期大量服用，则可能会使肝肾持续处于高负荷代谢状态，尤其对于肝肾功能本就较弱的人群，可能因代谢、排泄能力不足，导致成分在体内蓄积，间接引发肝肾损伤风险。
此外，本品的温燥之性较强，长期或过量服用会耗伤体内阴液。传统医学认为，肝主藏血、肾主藏精，而血和精均属于人体阴液的重要组成部分，若肝血和肾精不断被耗损，则会影响肝肾的正常生理功能。
需要注意，苍术必须在专业中医师的指导下辨证使用，明确自身体质与病情是否适合，其次严格控制用量与疗程，在症状缓解后及时停药，切勿擅自长期过量服用。