芡实不是莲子，二者在来源、性状、功效作用等方面均存在差异。
1、来源不同：芡实为睡莲科植物芡的干燥成熟种仁；而莲子为睡莲科植物莲的干燥成熟种子。
2、性状不同：芡实呈类球形，多为破粒，表面有棕红色或红褐色内种皮，一端黄白色，有凹点状的种脐痕，除去内种皮显白色，质较硬，断面白色，粉性，气微，味淡；而莲子略呈椭圆形或类球形，表面红棕色，有细纵纹和较宽的脉纹，一端中心呈乳头状突起，棕褐色，多有裂口，其周边略下陷，质硬，种皮薄，不易剥离，子叶2，黄白色，肥厚，中有空隙，具绿色莲子心，或底部具有一小孔，不具莲子心，气微，味甘、微涩，莲子心味苦。
3、功效作用不同：芡实与莲子均味甘、涩，性平，主归脾、肾经，皆能益肾固精、补脾止泻、止带，均可用于治疗肾虚遗精、遗尿，脾虚食少、泄泻，脾肾两虚之带下不止。但是，莲子又能养心安神、交通心肾，用于治疗心肾不交所致的虚烦、心悸、失眠；而芡实益脾肾固涩的同时，又能除湿止带，故为虚、实带下证之常用药物。
需要提醒的是，芡实与莲子虽属于药食同源之品，但并非适合所有人群，均需根据体质与证候辨证选用，不可自行盲目服用，食用时也需煮熟煮透，避免加重肠胃负担。