芡实和薏仁的功效区别可以从传统医学和现代医学两个角度加以说明。
1、传统医学角度：芡实味甘、涩，性平，归脾、肾经，具有益肾固精、补脾止泻、除湿止带的功效，常用于治疗遗精滑精、遗尿尿频、脾虚久泻、白浊、带下等；而薏仁味甘、淡，性凉，归脾、胃、肺经，具有利水渗湿、健脾止泻、除痹、排脓、解毒散结的功效，主要用于治疗水肿、脚气、小便不利、脾虚泄泻、湿痹拘挛、肺痈、肠痈、赘疣、癌肿等。
2、现代医学角度：现代药理学研究发现，芡实含有多酚、倍半新木脂素、生育酚、脑苷脂和环二肽等成分，具有抑菌、抗氧化、抗心肌缺血、保护胃黏膜、改善肾损伤、降血糖、降血压、抗衰老等作用；而薏仁含有甘油三油酸酯、薏苡素等成分，具有调节胃肠道、降脂、降糖、镇痛、调节免疫、雌激素样、抗辐射等作用。
需要提醒的是，芡实与薏仁虽同为药食同源且均具有健脾祛湿作用，但药性与功效侧重差异显著，因此药用时不可随意替代，需要在专业医师的指导下根据证型选用；食用时也需煮熟煮透，以减轻肠胃负担。