金银花与断肠草的区别，主要在于二者的来源不同、功效不同、主治不同以及安全性不同。
1、来源不同：金银花为忍冬科植物忍冬的干燥花蕾或带初开的花；而断肠草为马钱科钩吻的根和茎。
2、功效不同：金银花味甘，性寒，入肺、心、胃经，具有清热解毒、疏散风热的功效，炒炭后具有解毒、凉血、止痢之功；而断肠草味苦、辛，性温，具有祛风、攻毒、止痛的功效。
3、主治不同：金银花生品常用于治疗痈肿疔疮、喉痹、丹毒、热毒血痢、风热感冒和温病发热，炒炭后常用于治疗热毒血痢、便下脓血；而断肠草常用于治疗疥癞、湿疹、瘰疬、痈肿、疔疮、跌打损伤、风湿痹痛、神经痛和陈旧性骨折等。
4、安全性不同：金银花是药食同源的常用食材，安全性高，正常剂量食用或药用均无毒性；而断肠草有大毒，只能外用，不能内服。
需要提醒的是，断肠草的药用需严格遵循医嘱，外用时也需避免接触黏膜，以防局部刺激或吸收中毒，切勿擅自使用。