夏枯草的药用部位以果穗为佳。
1、符合药典标准：依据《中华人民共和国药典》规定，夏枯草为唇形科植物夏枯草的干燥果穗，其药材性状、成分含量均有明确质控标准，是临床用药的规范选择。
2、有效成分集中：夏枯草的核心活性成分如迷迭香酸、齐墩果酸、熊果酸、芸香苷、木犀草素等，主要富集在果穗部位，这些成分是其发挥清肝泻火、散结消肿功效的物质基础。而其茎叶部位的有效成分含量显著低于果穗，药用价值相对有限。
需要提醒的是，夏枯草果穗的采收时机也会影响药效，以夏季果穗呈棕红色、半枯萎时采收为宜，此时有效成分含量达到峰值，晒干后入药质量最佳。此外，采收后的夏枯草果穗需及时除去杂质，置于通风干燥处阴干或晒干，避免暴晒或淋雨导致有效成分流失、药材霉变，然后储存在干燥、阴凉、通风处，防止受潮、虫蛀，以保证药材的质量和药效。