酸枣仁应该贮藏于干燥容器内，密闭保存，并置于通风干燥处。
1、贮于干燥容器：选用洁净、干燥、无异味的玻璃瓶、陶瓷罐或食品级密封盒等容器存放酸枣仁，这类容器可有效阻隔外界湿气、灰尘与微生物，为保存提供基础稳定环境。
2、密闭保存：酸枣仁富含脂肪油与皂苷等成分，敞口放置易吸潮、氧化、走油，进而降低药效、发生霉变虫蛀。因此，每次取用后应立即盖严容器口，切勿长时间敞开，尤其在梅雨季节更需注意。
3、通风干燥的环境：高温高湿环境易导致药材发霉、虫蛀、泛油变质，保持环境干爽透气，才能长期维持药材品质。因此，应将酸枣仁放置在阴凉、通风、干燥处，避免靠近厨房、卫生间等高湿区域，远离热源与阳光直射。
需要注意，已打成细粉的酸枣仁比整粒更易吸潮结块，保存要求更严格。建议少量分次打粉、尽快服用，同样密封避光存放，若出现发霉、异味、黏结成团等现象，则应立即停止使用，不可继续服用。