菟丝子的核心功效为补益肝肾、固精缩尿、安胎、明目、止泻，外用还具有消风祛斑之功。
1、补益肝肾、固精缩尿：菟丝子味辛、甘，性平，入肝、肾、脾经。辛能润，甘能补，其性平和，故本品既可补肾阳，又能补肾阴，为阴阳俱补之品。具有补益肝肾、固精缩尿的功效，常用于治疗肝肾不足所致的腰膝酸软、阳痿遗精、遗尿尿频等症。
2、安胎：菟丝子能补肝肾、固冲任而安胎，故又可治疗肝肾不足、胎元不固所致的肾虚胎漏、胎动不安。
3、明目：菟丝子可益肾养肝，使精血上注而有明目、聪耳之效，故可治疗肝肾不足所致的目昏耳鸣。
4、止泻：菟丝子能补肾益脾而止虚泻，常用于治疗脾肾阳虚所致的泄泻便溏。
5、消风祛斑：菟丝子外用可消风祛斑，适用于白癜风者。
需要注意，菟丝子虽为平补之药，但偏补阳，故阴虚火旺、大便燥结、小便短赤者不宜服用，以防加剧原有症状。 而且，服药期间应顾护脾胃，宜食熟软、易消化的食物，避免食用生冷、致泻的食物，以防影响药效的发挥。