整肠生和肠炎宁都可以用于治疗腹泻，但两者在成分、作用机制、治疗方向上有所不同。
整肠生，又叫地衣芽孢杆菌活菌胶囊或者地衣芽孢杆菌活菌颗粒，为西药，是一种益生菌，可以通过调整菌群失调而达到治疗细菌或者真菌引起的急慢性肠炎、腹泻的目的。由于整肠生是活菌制剂，不可以将其放在高温处，颗粒剂不能用超过40℃的水溶解。使用整肠生治疗的患者，偶尔可出现大便干结、腹胀的症状，长期、大量使用还可能导致便秘。
肠炎宁为中成药，具有清热利湿、行气的功效，用于大肠湿热导致的泄泻、痢疾，具体表现为大便次数明显增多、稀水样或脓血样大便、里急后重（下腹不适想要大便但又排便不爽）、腹痛、腹胀，也可用于有上述症状的急慢性胃肠炎、腹泻、细菌性痢疾、小儿消化不良。孕妇应避免使用本品。有慢性结肠炎、溃疡性结肠炎便脓血等慢性病史的患者，如果有腹泻的症状，应及时到医院就诊，如果症状严重，或者有里急后重、脓血便的情况，也要尽快就诊，在医师指导下用药治疗，不要自行用药。本品药性苦寒，容易损伤脾胃，出现呕吐、腹泻或便秘的症状，所以是不可以长期或者过量使用的，如果用药3天症状没有缓解，要及时与医师沟通或到医院就诊。
患者通常可以在药店自行购买使用两药，但如果不知道自己适合哪种药物的治疗，可以提前咨询医师或者药师，不要盲目用药，以免发生用药风险。