二者均载入《中国药典》，同属灵芝，药性平和，但外观、侧重功效、适用人群存在明显区分，可按需选择调养。
1、外观与成分含量不同
赤芝菌盖红褐色，光泽鲜亮，三萜类物质含量更高；紫芝通体紫黑，质地厚实，多糖占比更突出，生长周期比赤芝稍长，市面产量少于赤芝。
2、核心调理功效各有侧重
赤芝主攻安神、护肝、缓解咳喘，适合失眠烦躁、长期熬夜、肺虚易咳人群；紫芝偏重益气补肾、固本养颜，适合中老年体虚、腰膝酸软、气血亏虚、气色暗沉人群。
3、服用适配体质有差异
赤芝偏清调，湿热、容易上火人群日常饮用更合适；紫芝滋补力更厚重，体虚怕冷、气血不足者更佳，脾胃湿气重人群二者均建议搭配陈皮同服。
整体而言，赤灵芝安神护肺效果突出，日常通用性价比更高；紫灵芝补肾固本、滋养气血更强，适合中老年长期轻量调养。二者都滋腻碍胃，不可单一长期大量服用。