苍耳子主要用于治疗风寒表证、鼻塞流涕、鼻渊鼻鼽、痹证以及风疹瘙痒、疥癣麻风。
1、风寒表证：苍耳子味辛、性温，辛温宣散，主入肺经，能“上达颠顶，疏通脑户之风寒，为头风痛之要药”。因其有毒，且发汗解表之力较弱，故一般风风寒表证少用。若风寒感冒患者出现明显的头痛、鼻塞流涕，则可与防风、白芷、羌活等同用。
2、鼻塞流涕、鼻渊鼻鼽：苍耳子温和疏达，味辛散风，苦燥湿浊，善通鼻窍以除鼻塞、止前额及鼻内胀痛，故可用于治疗鼻塞流涕、鼻渊鼻鼽等多种鼻病，常与辛夷、细辛、白芷等同用。
3、痹证：苍耳子辛能散风，“苦能燥湿，温能通络”，故常用于风寒湿痹、关节疼痛、四肢拘挛等。可单用，或与羌活、独活、威灵仙等同用。
4、风疹瘙痒、疥癣麻风：苍耳子凭借辛散祛风除湿之功，可用于治疗风疹瘙痒、疥癣麻风。
需要提醒的是，苍耳子有毒，过量服用易致中毒，常损害肝、心、肾等内脏实质细胞。因此，患者应在专业医师的辨证指导下使用，以确保疗效和安全。