炒苍耳子仍然有毒，但毒性较生品显著降低。
苍耳子的毒性主要源于其含有的多种有毒成分，比如羧基苍术苷、苍耳苷、毒蛋白、生物碱等。虽然加热能使部分毒性蛋白变性失活，且炒制可使羧基苍术苷转化为苍术苷，再进一步降低苍术苷的量，进而显著降低苍耳子的毒性。但是，炒制并不能完全消除苍耳子的毒性成分，尤其是苍术苷类化合物在炒制后仍有一定残留，故炒苍耳子仍属“有毒中药”范畴。
苍耳子毒性对比实验（40g/kg灌胃，观察24小时）显示：生品组10只小鼠死亡8只（80%），炒品组死亡3只（30%），炒后去刺组无死亡（0%）。说明炒制及去刺能显著降低苍耳子的毒性，其中炒后去刺效果最佳。
需要提醒的是，炒苍耳子是有毒中药，只是毒性比生品小。因此，患者应在专业医师的指导下使用，切勿自行用药或者擅自更改剂量、疗程，以确保用药安全。