甲硝唑片能增强华法林等抗凝药物的作用，可能导致抗凝血过度，引起出血倾向，表现为伤口不易愈合，血流不止，异常的鼻出血，经常牙龈出血，皮肤表面瘀斑、血点等。所以通常不建议甲硝唑片与抗凝药物合用，或在医生调整剂量后合用，以减少这种出血风险。土霉素可干扰甲硝唑清除阴道滴虫的作用，两者合用会降低甲硝唑的药效，所以通常要避免合用。
除了上述两种药物，其他药物与甲硝唑片也可能发生药物相互作用，大家如果需要合用，一定要先咨询医生或药师，获得允许后才能一起吃，以免合用带来的严重风险。除了药物之外，甲硝唑片会抑制酒精的代谢，服药又喝酒可能引起腹痛、呕吐、头痛等不良症状，比平时单纯喝酒所引起的不适会更加严重，所以建议用药期间还要戒酒，也避免喝含酒精的饮料或药物。