在医学上，碳酸氢钠只是一种碱性药物，可以改变体内的酸性环境，具有调节酸碱平衡的作用。市面上常见剂型为碳酸氢钠片和碳酸氢钠注射液。其中碳酸氢钠片用于碱化尿液及酸血症，也可用于胃酸过多症状。而碳酸氢钠注射液用于治疗代谢性酸中毒、碱化尿液、治疗胃酸过多引起的症状，或者非特异性的治疗某些药物中毒，如巴比妥类、水杨酸类药物。
由于每个人的体质不同，部分人服用碳酸氢钠片后可能引起嗳气及继发性胃酸分泌增加等不良反应。大量注射碳酸氢钠注射液后，患者可能出现心律失常、肌肉痉挛、疼痛、异常疲倦、虚弱等。肾功能不全的患者注射碳酸氢钠注射液后可能出现水肿、精神症状、肌肉疼痛或抽搐、呼吸减慢、口内异味、异常虚弱，长期使用碳酸氢钠注射液后还可能出现尿频、尿急、持续性头痛、食欲减退等不良反应。