卵巢巧克力囊肿又称卵巢子宫内膜异位囊肿。子宫内膜正常情况下长在子宫腔，但是由于种种原因，有活性的子宫内膜顺着经血从输卵管逆流到盆腔，并种植到盆腔的任何地方。当子宫内膜种植到卵巢时，患者每次来月经，除了在子宫腔里的内膜都脱落出血，在卵巢上有活性的内膜也会有出血的现象。出血之后局部会有粘连包裹，到最后在卵巢上形成血包，也就是囊肿，时间长了之后，血包会变成巧克力色，所以叫做巧克力囊肿。