红霉素和阿奇霉素都属于大环内酯类抗生素，作用机制和抗菌谱基本类似，但他们也有一些差异，具体有以下几个方面：
1、化学结构不同，红霉素属于第1代14元环大环内酯类抗生素，阿奇霉素是在红霉素结构上修饰后得到的一种广谱抗生素，属于第2代15元环大环内酯类抗生素。
2、抗菌谱略有不同，阿奇霉素对金黄色葡萄球菌与链球菌的效果与红霉素相当，但是对于肺炎支原体、沙眼衣原体的效果优于红霉素。
3、半衰期不同，一般来说，红霉素每天需服用2-3次，而阿奇霉素通常一天只需要服用一次。
4、胃肠道反应不同，红霉素由于对酸不稳定，胃肠道不良反应明显，限制了它的临床应用。阿奇霉素与红霉素相比，对酸的稳定性大大加强，胃肠道反应少，口服吸收好。
如果要使用这两种药物，要在医生的指导下，根据所得的病以及具体的病原菌类型，针对性的用药，不能盲目滥用。