新生儿腹泻病的治疗主要包括对因治疗、对症治疗和支持治疗三大类。

1、对因治疗

新生儿腹泻病首先需要积极寻找病因，针对病因进行相应的治疗。如细菌感染引起者，应用抗生素治疗。对于牛奶中的蛋白过敏者，其母亲在哺乳期间应避免摄入牛奶。但是对于轮状病毒感染所致者，目前没有特效药物。

2、对症治疗

蒙脱石散可以减少肠道的液体分泌，对于缓解腹泻有一定的作用。如果患儿腹泻严重，出现尿量减少、前囟凹陷、皮肤弹性差等脱水的表现，需要采取措施及时纠正。

3、支持治疗

除了对因治疗和对症治疗之外，还可以应用一些药物来调整肠道菌群。