新生儿颅内出血主要引起神经系统后遗症，根据颅内的出血位置、出血程度以及治疗效果不同，后遗症表现会有所差异。

1、脑室内出血可以导致脑脊液循环不通畅，而在整个脑脊液循环过程中，相对比较狭窄的中脑导水管容易被堵塞，中脑导水管堵塞以后会出现第三脑室和第四脑室的扩张，进而形成占位效应，导致脑积水，并且引起脑室周围白质出现损伤。远期患儿可能出现脑瘫、癫痫、认知发育障碍、注意力缺陷等后遗症。

2、脑实质出血即使出血稳定以后，也可能导致癫痫、认知缺陷、注意力缺陷、语言落后、计算功能相对低下等后遗症。