目前暂时没有甲硝唑栓相关的联合用药的禁忌，大部分药物可以和甲硝唑栓同时使用，但由于每个人体质与病情的不同，不排除个别发生药物相互作用的情况。用药期间出现任何严重、持续或进展性的症状，也应及时就医。
使用前，需要注意以下事项，孕妇应该在医生的指导下使用甲硝唑栓，妊娠3个月之内不推荐使用。哺乳期妇女使用甲硝唑栓前，应该先咨询医生，权衡利弊之后再考虑是否使用。用药期间最好避免性生活，防止交叉感染，尽量每天更换内裤，洗完内裤后在阳光下暴晒，还应该注意洗涤用具的消毒，以防重复感染。而且不可以自行冲洗阴道，以免影响治疗效果。
有些人在使用甲硝唑栓后会排出一些类似于棕黄色的颗粒状物并且可能混有一定量的阴道白带，这是药物被阴道上皮细胞吸收后剩下的药物残渣以及阴道分泌物的结合物，出现这这种情况时，不必惊慌，是正常的现象，必要时最好垫上护垫，以防弄脏衣物或者床单。