甲钴胺最大的副作用应该是过敏反应，虽然过敏反应极少发生，但是如果你用药后出现皮疹、皮肤瘙痒、红肿的情况，请立即停药，必要时可以咨询一下医生。还有部分人吃了甲钴胺后，会出现胃肠道不适，表现为食欲不振、恶心、呕吐、腹泻等，这些症状一般停药后很快会消失。
相关实验发现，甲钴胺可以通过乳汁分泌，目前还不能确定它是否会影响到胎儿的生长发育。因此孕妇和哺乳期妇女，出于安全性的考虑，一定要先咨询医生后，再决定是否使用甲钴胺片进行治疗。如果你服用甲钴胺一个月以上，相关症状并没有得到明显改善，那就没有必要再吃了。长期使用甲钴胺可能会引起不可逆的神经损伤，因此长期用药一定要在医生的指导下进行。