甲钴胺是一种营养神经的药物，使用起来相对比较安全，禁忌症比较少。但是如果你使用后，出现皮疹、皮肤瘙痒、红肿等过敏症状，那么以后就不能再使用甲钴胺了。此外，从事汞及含汞化合物加工的工作人员，不能长期或大剂量地使用甲钴胺，因为甲钴胺与汞可在人体内形成甲基汞，导致人体肾脏、大脑等多器官损伤。
甲钴胺在动物试验中没有表现出致畸作用，但目前还不清楚它是否会影响到胎儿的生长发育，相关实验表明甲钴胺可以通过乳汁分泌。因此孕妇和哺乳期妇女，出于安全性的考虑，一定要先咨询医生后，再决定是否使用甲钴胺进行治疗。长期吃甲钴胺可能会引起不可逆的神经损伤，因此长期用药一定要在医生的指导下进行。