大部分的卵巢囊肿体积较小，患者通常没有明显的症状和不适感，主要在体检中进行B超检查时被发现。有痛经症状的子宫内膜异位囊肿，即卵巢巧克力囊肿，一般通过B超检查和体格检查才能被发现。对于巨大的卵巢囊肿，患者可能出现腰部不适、腰酸、尿频、尿急等压迫症状，一般通过体格检查便可以发现，部分患者自己也能在腹部触及到包块。

需要注意的是，在进行B超检查前，患者通常需要排便，从而减少检查的误差。