杞菊地黄丸具有滋肾养肝的功效，用于肝肾阴亏导致的眩晕、耳鸣、双目干涩、眼睛怕光、迎风流泪、视物模糊，还可用于有上述症状的原发性高血压、老年性白内障初期、干眼症等。现代药理学研究表明，本品具有降血脂、抗动脉粥样硬化、抑制血小板聚集、肾保护、抗氧化等作用，临床上还用于治疗2型糖尿病、慢性肾盂肾炎、预防先兆子痫、老年黄斑变性等。
杞菊地黄丸的使用通常没有明显的年龄限制，一般只要有相应的病症，就可以考虑使用本品治疗。但年龄比较小的患者不要自己用药，应到医院就诊，在医师综合考量之后，再合理使用药物治疗。
除此之外，孕妇、哺乳期妇女、年老体弱者，以及伴有严重疾病的患者，也应在医师指导下使用，以免自行用药而发生用药风险。实火亢盛所导致的头晕、耳鸣者，此类患者可伴有口干、口苦、烦躁、咽喉痛、小便深黄等症状，请慎用本品；平时脾虚而大便不成形的患者也要慎用。