明目地黄丸和杞菊地黄丸在组成和功效上都有所区别。明目地黄丸的组成成分是在杞菊地黄丸的基础上，加了蒺藜、煅石决明、当归、白芍4味药。两药都可以用于治疗肝肾阴虚导致的双目干涩、眼睛怕光、迎风流泪、视物模糊，但明目地黄丸治疗眼科疾病的效果要强于杞菊地黄丸，杞菊地黄丸则更侧重于滋肾益肝，用于肝肾阴亏导致的眩晕、耳鸣、腰膝酸软、睡后异常出汗等。
通过以上分析，可以看出两者侧重的治疗病症是有所不同的。患者用药前，应明确自己适合使用哪种药物治疗，如果自己不能判断，可以咨询药师或者医师。通常服药2周症状可有一定程度的缓解，如果症状没有改善，请及时到医院就诊，以免耽误治疗。