卵巢早衰的发生与内分泌失调有关系。卵巢早衰是一种内分泌紊乱性疾病，指40岁以前由于卵巢功能下降所引起的闭经的现象。
1、下丘脑-垂体-卵巢轴是一个完整而协调的神经内分泌系统，调控着女性的生殖生理功能，每个环节都有独特的神经内分泌功能。下丘脑分泌促性腺激素释放激素，垂体分泌促卵泡生成素和促黄体生成素，卵巢分泌雌激素、孕激素和雄激素，其中任何一个环节出现问题，都会引起卵巢早衰。
2、其他的内分泌器官异常，也会影响卵巢的功能。甲状腺功能异常，如甲状腺功能减退或甲状腺功能亢进，均会影响卵巢的功能，引起卵巢早衰。另外，若患有肾上腺肿瘤或者肾上腺皮质功能亢进，体内的激素尤其是雄激素可发生紊乱，也可能会影响卵巢的功能，造成卵巢早衰。
3、除此之外，一些医源性的因素或者肿瘤的化疗、放疗，也可影响卵巢的功能，导致其早衰。
总而言之，卵巢早衰本身就是一个内分泌疾病，内分泌的紊乱也会造成卵巢早衰。