连花清瘟胶囊具有清瘟解毒、宣肺泄热的功效，现代药理研究表明，本品还具有抗菌、抗病毒、抗炎、解热等作用，可用于治疗热毒袭肺证的流行性感冒，此类患者具体可见发热或高热、怕冷、肌肉酸痛、咳嗽、头痛、咽干、咽痛等症状。
患者通常可以自行购买连花清瘟胶囊使用，用药前应仔细阅读说明书，了解药物的禁忌、注意事项等，减少用药风险。风寒感冒者（表现为怕冷程度重、发热程度轻、无汗、鼻流清涕、咳吐白痰等症状）不适合使用本品治疗，以免导致症状加重。孕妇、哺乳期妇女、儿童、年老体弱者、脾虚大便不成形者，以及慢性病者（如高血压、心脏病患者，以及糖尿病、肝病、肾病等严重者）应在医师指导下，按照医嘱用药，以减少自行用药风险。发热体温超过38.5℃的患者，应及时到医院就医处理。