乙肝抗病毒治疗药物目前主要分为两类，疗程是不一样的。

1、干扰素

如聚乙二醇干扰素，治疗48周或者52周，或称之为一年，不管取得什么样的疗效，就只能治疗这么长的时间。研究表明，经过每周一次，过程长达一年的长效干扰素注射，三分之一左右的患者可能会达到免疫的控制。

2、口服抗病毒药物

如果干扰素治疗未能达到免疫控制，可以转为口服抗病毒治疗，注射不方便的患者也可以采用口服药物，如恩替卡韦、替诺福韦酯、丙酚替诺福韦，这三个药物都有疗效好、副作用少的特点。口服药物的治疗周期取决于能够达到e抗原血清学转换，即e抗原从阳性变为阴性，e抗体从阴性变为阳性。经过连续6个半年，就可以尝试停药。之所以说6个半年，而不是3年，是因为每隔半年都要重复检测一次，以确保这个状态。停药以后，还会有50%~80%的患者出现反弹，所以可以尝试停药，也可以不停药。如果患者表面抗原阳性、e抗原阴性，e抗体和核心抗体阳性，则需要达到表面抗原阴性，才能尝试停药。