他克莫司软膏适用于因潜在危险而不适合使用传统疗法、或对传统疗法反应不充分、或无法耐受传统疗法的中到重度特应性皮炎患者，它可以作为短期使用，或者是间歇性的长期使用。成人可以用0.03%和0.1%浓度的他克莫司软膏，但2岁及以上的儿童只有0.03%浓度的他克莫司软膏可以用，而且不适用于2岁以下的儿童。
他克莫司软膏可以治疗各种各样的特应性皮炎，但它为处方药，需要在医生的指导下去使用，不要因为自己得了皮肤性疾病，就私自的去给自己诊断，并且使用药物，应根据医生的具体的诊断，针对性地使用，才能够对于疾病的治疗起到一个很好的效果。在使用他克莫司软膏的时候，应该注意在患病处涂上一薄层，并且轻轻地擦匀就可以了，使用次数要按医生的处方来进行。
患者还要注意，不要用绷带、衣服或缚裹包住治疗区的皮肤。使用他克莫司软膏后，最好用肥皂和水清洗双手，以减少因手上的药物吸收而导致的不良反应。另外，他克莫司软膏有可能导致皮肤更容易晒伤，所以用药患者最好尽量减少或避免暴露于自然、人工日光下，可以穿上防晒衣物或使用防晒产品再去户外。用药期间出现任何严重、持续或进展性的症状，应及时就医。