儿童嗜睡症的孩子会出现睡眠的节律紊乱，如白天贪睡，晚上不睡等，这种状态会造成孩子内分泌和免疫功能的紊乱。

1、对内分泌系统的危害

孩子正处于生长发育期，午夜的深睡眠是孩子生长激素高峰出现的时间，如果孩子在午夜时不能进入深睡眠，就会缺失午夜的生长激素高峰，造成孩子生长发育迟缓，而这种生长发育的迟缓在青春期的影响是终身的。

2、对免疫系统的危害

孩子睡眠的紊乱会造成免疫功能的紊乱，会出现一些免疫性疾病，如免疫力过强或免疫力低下等。免疫力过强会出现风湿免疫性疾病、过敏性紫癜甚至其他的免疫系统疾病，造成终身性的器官损害。免疫性过低会造成感染性疾病甚至会增加肿瘤性疾病的发生率。