儿童需要在医生的指导才能使用藿香正气口服液，具体用药量应由医生确定，要严格遵医嘱用药。
本品是一种中成药，相对来说比较安全，医生一般会根据成人剂量来折算儿童的剂量，比如9-14岁的儿童可以用成人剂量的1/2-1/3，然后根据儿童的体重估算用量就可以了，如果孩子偏瘦，个子偏小，就用下限值1/3；稍微高一点，壮一点的孩子就用上限值1/2，这种方法易于掌握，但是比较粗糙。不建议家长自行给孩子用药，以免出现严重的药物副作用。
家长给孩子口服本品之后，需要注意观察孩子有没有出现胃肠道不适及过敏的现象，如果发现问题需要及时停止用药，必要的时候应该及时就诊。服药期间，不宜给孩子同时服用滋补性中药，如党参、黄芪、当归、肉桂等；不要吃辛辣、生冷、油腻食物，饮食宜清淡。
