脑发育不良的原因非常复杂，主要包括：

1、产前因素：风疹病毒等宫内感染可以导致胎儿脑发育不良。患儿出生以后，可以观察到脑部出现一些钙化、皮质薄等情况。

2、遗传因素：主要为基因或染色体异常。如唐氏综合征、一些m-TOR通路相关的基因异常等可能导致涉及到的部位，范围、大小不一的发育异常，出现半侧的巨脑、脑回的畸形、外侧类畸形、多脑回畸形等。