首先，清火胶囊和牛黄解毒片组成成分不同，清火胶囊由大青叶、大黄、石膏、薄荷脑组成，而牛黄解毒片由人工牛黄、石膏、黄芩、大黄、雄黄、冰片、桔梗、甘草组成。
其次，清火胶囊和牛黄解毒片在功效上有些许的差异。两药都可以清热解毒，用于火热内盛导致的咽喉肿痛、牙痛、口舌生疮、目赤肿痛。但牛黄解毒片的作用强于清火胶囊，更适合于疼痛剧烈、高热、烦躁干渴等情况。
最后，两药的处方类型不同，牛黄解毒片为处方药，需要在医师指导下使用。而患者通常可以根据自己的症状，自行购买清火胶囊使用，相对于牛黄解毒片更方便购买，且安全性更高些。