女性患者可以使用麝香痔疮栓，但哺乳期妇女禁用，孕期女性慎用。本品可能会影响乳汁分泌，也可能通过乳汁对乳儿产生不良影响，所以哺乳期妇女不要使用麝香痔疮栓。本品中含有的麝香有兴奋子宫的作用，可能会增加流产或者早产的风险，所以孕妇需要谨慎使用，建议由医师诊断之后再用药治疗。
短时间使用麝香痔疮栓对备孕的影响通常不大，但每个人体质不一样，如果实在担心药物可能带来的损伤，建议就医时将备孕情况告知医师，由医师为您制定安全有效的用药方案。由于本品中还含有活血成分，月经期间使用可能导致出血量增大，所以经期女性请慎用。
除了上面所说的情况，年老体弱者，以及高血压、青光眼、前列腺肥大、严重肝肾疾病、糖尿病、血液病等患者应在医师指导下使用，减少用药风险。原因不明的便血，或者内痔出血过多，或内痔脱出不能自行恢复的患者，要及时到医院就诊，不可自行用药治疗。
麝香痔疮栓为直肠给药，禁止内服。患者用药前，最好先排便，然后采取侧卧位，将本品缓慢轻柔的推入肛门内，适当置入一定深度以防药物滑脱。本品不宜长期使用，如果用药3天症状不见改善，要到医院诊治。用药期间，还要注意清淡饮食，不吃辛辣、油腻、刺激性食物，多吃新鲜蔬菜水果，保持大便通畅，戒烟戒酒。