冲服枯草杆菌二联活菌颗粒时，两岁以下的儿童一次一袋，一日1-2次；两岁以上的儿童，一次1-2袋，一日1-2次。如果是孩子第一次吃本品，最好先咨询医生或药师，给出合适的剂量。还要注意，一定要用40度以下的温开水或牛奶冲泡颗粒，温度不可过高，以免破坏益生菌的活性。
枯草杆菌二联活菌颗粒主要用于儿童消化不良、食欲不振、营养不良，肠道菌群紊乱引起的腹泻、便秘、腹胀、肠道内异常发酵、肠炎，以及使用抗生素引起的肠粘膜损伤等症。儿童必须在成人监护下服，服用枯草杆菌二联活菌颗粒期间，如果需要服用抗生素，最好错开用药时间，避免同服。铋剂、鞣酸、药用炭、酊剂等能抑制、吸附活菌，也不能与枯草杆菌二联活菌颗粒同服。服药期间如果孩子出现任何不适，或症状一直未缓解，需要及时联系医生。