滋养细胞肿瘤根据其具体疾病有不同的原因。

1、葡萄胎的原因尚不明确。可能与卵子质量有关。此外，目前还有很多学说。如空卵受精学说，即正常人的染色体一半来自父系，一半来自母系。而葡萄胎妊娠是两个精子进入空卵里，所以两个染色体全部来自父系，没有母系的染色体。

2、绒癌、胎盘部位滋养细胞肿瘤（PSTT）、上皮样滋养细胞肿瘤（ETT）等可继发于足月产、流产或者是宫外孕等任何妊娠，是某种滋养细胞恶变导致，但病因尚不明确。