多烯磷脂酰胆碱胶囊是甲类非处方类药，患者可以自行在药店购买使用，但第一次服用前最好还是咨询一下医生。以每粒含多烯磷脂酰胆碱228mg的多烯磷脂酰胆碱胶囊为例，除非医生处方特别指出，12岁以上的儿童、青少年和成年人刚开始服药时，每天吃3次，每次吃2粒（456mg），每日最大服用量不能超过6粒（1368mg）。一段时间后，剂量可以减少到每日3次，每次1粒（228mg）。而且，多烯磷脂酰胆碱胶囊最好随餐、用足量温水送服，不要咀嚼后吞下，以免引起胃肠道不适。如须长期服用，请遵医嘱使用。
由于本品中含有大豆油成分，因此对大豆过敏的患者应该避免使用。一般也不推荐孕妇、哺乳期妇女和12岁以下儿童使用本品。服药期间，禁止喝酒或含酒精的饮料，以免加重肝脏负担，造成更严重的损害。多烯磷脂酰胆碱胶囊一般是在患者的肝炎症状比较明显的时候使用，如果经过有效的治疗之后，肝脏内炎症已经缓解，这时候就要在医生的指导下及时停药，针对病因进行管理和治疗。