卵巢囊肿手术后一般不会影响怀孕。

1、部分卵巢囊肿，如巧克力囊肿等，可能会引起不孕。一些患者进行腹腔镜手术后，能够促进怀孕。

2、少数卵巢囊肿，如输卵管系膜囊肿等，在进行手术后可能会使得盆腔出现创面，从而发生粘连，最终导致（不孕）不育。

3、由于粘液性囊腺瘤等复发频率较高的卵巢囊肿，对卵巢的破坏较为严重，手术治疗也对卵巢的破坏较大。因此，个别患者在进行手术后可能存在闭经、不排卵等情况，进而影响怀孕。