多数卵巢囊肿术后不会复发，但少数仍存在复发可能。如：

1、巧克力囊肿比较容易复发。由于巧克力囊肿本身为多房性，不易被完全剔除。且其属于子宫内膜异位囊肿，可受雌激素影响，而增加复发几率。

2、畸胎瘤发生于双侧卵巢的概率为25%，其术后复发的概率也为25%。