硝酸咪康唑乳膏是皮肤科常用的抗真菌药，使用时，只需要取适量涂抹在患处，轻轻按摩以促进药物吸收，如果是皮肤感染的患者，早晚各使用1次，症状消失后（通常需2-5周）应继续用药10天，以防复发；如果是指（趾）甲感染患者，尽量剪干净指甲，一日使用1次，患甲松动后（约需2-3周）应继续用药至新甲开始生长。确见疗效一般需7个月左右；如果是念珠菌阴道炎的患者，每日就寝前用涂药器将药膏（约5g）挤入阴道深处，一般需要连续使用2周，月经期内也可以用药。
硝酸咪康唑乳膏仅限于外用，使用过程中避免接触眼睛和其他黏膜（如口、鼻等）。如被意外大量口服，可采取适当的胃部排空措施，如催吐等。用药部位如有烧灼感、红肿等情况应停药，并将局部药物洗净，必要时向医师咨询。由于本品可能对胎儿以及乳儿造成影响，因此孕妇及哺乳期妇女用药前咨询医生，权衡利弊之后再考虑是否使用本品。