不同类型的儿童甲状腺炎，其病因也有所差异。其中，桥本氏甲状腺炎可能与自身免疫有关，而亚急性甲状腺炎可能与感染、自身免疫等有关。
1、桥本氏甲状腺炎（hashimoto thyroiditis）是儿童甲状腺炎最常见的一种类型。其主要是自身免疫的抗体破坏了甲状腺组织，从而导致甲状腺无法发挥正常的功能，出现甲状腺功能减退的情况。患儿一般需要经历甲亢期、甲减期这两个不同的过程，从而产生相应的临床表现。通常需要甲状腺激素来进行终身替代治疗。
2、亚急性甲状腺炎在儿童甲状腺炎中比较少见。目前认为，本病的发生可能与上呼吸道感染有关，也可能与自身免疫等有关。
