神经纤维瘤病是由于基因突变导致的。基因突变可为种系突变，也可为胚胎时期出现基因突变。

1、种系突变是精子和卵子结合之前精子或者卵细胞就发生了基因突变。其发育来的全身所有细胞都有神经纤维瘤病的NF1或NF2基因发生突变。

2、胚胎时期出现基因突变指受精卵结合发育成多细胞的胚胎以后，其中的一个细胞发生基因突变。突变基因发育来的所有组织可出现神经纤维瘤病的症状，又叫节段型神经纤维瘤病。