孕妇必须在医生指导下才能用甲硝唑氯己定洗剂。
一方面，本品药物虽然经阴道粘膜局部吸收，但大量吸收也可能引起全身性的反应，可能透过胎盘，对胎儿有潜在危害，所以由医生判断用药剂量更加安全。另一方面，本品需器具塞入阴道深处给药，孕妇如果用药方式不当，可能会影响妊娠进程，尤其是已经七八个月的孕妇，通常也不方便自行用药，用药姿势需要特别谨慎。
为了减少妊娠期用药，孕妇宜关注自己平时的生活习惯与卫生。平时要注意私密处的清洁护理，经常晾晒床单被褥，经常换洗内裤，内裤清洗后宜高温消毒杀菌；内裤尽量选择宽松、透气的，比如纯棉的材质；日常养成多饮水的习惯，尿流冲洗尿道有利于预防尿道炎；每次小便后，及时将外阴擦拭干净，减少护垫的使用；性伴侣也要注意私处卫生，如果有感染应当接受治疗，防止交叉感染。