扁平苔藓一般不会影响到患者的寿命，大多数扁平苔藓患者的预期寿命与正常人相同。但少数比较严重的扁平苔藓或未能获得正规治疗的扁平苔藓，可能会发生恶变，从而影响患者寿命。如发生于足跟部的扁平苔藓可由于反复摩擦而导致糜烂，或者是反复发作的口腔黏膜糜烂型扁平苔藓，若未能获得及时的治疗，则可能继发为皮肤鳞状细胞癌。且鳞状细胞癌如果没有及时处理，则可能会发生转移，进而影响到患者寿命。