头皮毛囊炎的病因主要有以下六个方面：

1、头皮毛囊炎最常见的原因是细菌感染，如金葡菌、链球菌感染等。

2、由真菌感染引起的头皮毛囊炎，主要表现为黄癣、脓癣等。

3、自身免疫性疾病也可能会引起头皮毛囊炎，如嗜酸性粒细胞增多症。

4、外伤可能会造成皮肤屏障功能破坏，引起头皮毛囊炎，如搔抓、植发手术等。

5、内分泌疾病也可能会引起头皮毛囊炎，如糖尿病等。

6、自身免疫功能低下，如艾滋病、长期使用免疫抑制剂的患者就比较容易出现头皮毛囊炎。