妊娠头三个月者禁用熊去氧胆酸胶囊，其他孕期者慎用，需要由医生权衡利弊后判断能否用药。
动物实验发现妊娠早期使用熊去氧胆酸胶囊会导致胚胎毒性，但人体妊娠前三个月用熊去氧胆酸胶囊的研究数据还不足够，所以安全起见，前三个月的妊娠期内禁止服本品。
因此，除了孕妇禁用熊去氧胆酸胶囊之外，育龄妇女服本品期间，也要采取安全有效的避孕措施，以防怀上不健康的胎儿。如果服药期间发现了妊娠，也要立马去医院检查，排除或纠正药物对胎儿的影响。
熊去氧胆酸胶囊可治疗胆囊胆固醇结石、胆汁淤积性肝病（如原发性胆汁性肝硬化）、胆汁反流性胃炎。临床也将熊去氧胆酸胶囊用于治疗胆固醇型胆结石及胆汁缺乏性脂肪泻，还能预防药物性结石，以及治疗回肠切除术后的脂肪痢。