先天性青光眼可以通过眼轴、眼压以及角膜的改变进行诊断，检查方式包括：

1、眼压检测：先天性青光眼患者的眼压，多次测量均应大于21mmHg。婴幼儿的眼压检测，医生可能会建议在麻醉下进行检查，使被检查者能够完全配合，以免出现较大的误差。

2、角膜检查：先天性青光眼患者角膜直径比正常发育的同年龄段婴幼儿更长，角膜发生混浊。角膜检查还可能发现典型的哈布氏纹。哈布氏纹是角膜后弹力层破裂的标志，提示患者的眼压曾达到很高的数值，导致了角膜后弹力层的破裂。

3、A超、B超检查：先天性青光眼患者进行A超检查，其眼轴长度明显长于正常发育的同年龄婴幼儿。此外医生通过B超检查，可以排除先天性眼部肿瘤等疾病。