氟康唑胶囊的服用时间没什么特殊限制，饭前吃或饭后吃，早上吃或晚上吃都行，如果医生有要求，听医生的就行。另外，氟康唑胶囊可能引起恶心、呕吐反应，对这类反应敏感的患者可考虑饭后吃药，或许可以减轻胃肠道不良反应。
患者使用氟康唑胶囊的疗程需根据感染部位及个体治疗反应，来决定合适的用药剂量，一定要遵照医生的建议，按照医生推荐的用法用量以及用药疗程来服用。患者应该将氟康唑胶囊完整吞服，不要掰开或咀嚼。另外，氟康唑容易和其他药物发生药物相互作用，因此使用前应把正在服用的其他药物告知医生或药师，由医生做出判断。
在服用氟康唑胶囊治疗前和治疗过程中，应定期检查肝功能，如果肝功能持续异常，或出现肝毒性临床症状，如皮肤发黄、眼白发黄、右上腹痛、泥状大便、严重恶心以及呕吐时，请立即联系医生。