复方多粘菌素B软膏可以涂痘痘，但不是专门治疗痘痘的药物。复方多粘菌素B软膏主要是消炎的药膏，用于预防皮肤割伤、擦伤、烧烫伤、手术伤口等皮肤创面的细菌感染和临时解除疼痛和不适。如果涂到有炎症的痘痘上，可以缓解炎症，但它对粉刺效果并不好，像黑头粉刺、白头粉刺这一类的治疗效果更差。
痘痘的发生机制和表皮的异常过度角化、毛囊孔堵塞、内分泌有关系，和微生物相关的是痤疮丙酸杆菌，而复方多粘菌素B软膏对痤疮丙酸杆菌的作用有限，所以它不能控制致病的微生物，对痘痘的作用也是有限的。若脸上出现痘痘，应该注意养成良好的作息习惯，调节内分泌，饮食以清淡为主，多吃新鲜的蔬菜、水果，避免进食辛辣刺激及高脂肪的食物，以促进痘痘的消退。