取卵手术是一种有创性操作，可能造成损伤、出血以及感染等问题，严重者需要进行开腹器官修补和止血手术，感染严重时还存在败血症的风险。

取卵需要在促排卵后进行。一般医生会根据患者的自身情况选择合适的促排卵方案，经过一段时间的促排卵治疗，在卵泡达到成熟标准时注射人绒毛膜促性腺激素(HCG)。而取卵的手术时间通常在HCG注射后34～38小时内，一般在超声的引导下通过穿刺抽吸将卵子取出。