儿童智力发育障碍的原因主要包括孕产期或分娩异常、代谢性疾病、基因突变或染色体异常等。
1、宫内感染等孕产期的问题，分娩时婴儿出现缺氧、窒息等情况，分娩后发生黄疸、胆红素脑病、颅内的感染、外伤等疾病，都可能导致儿童智力发育障碍。
2、先天的、遗传性的、与基因或染色体有关的代谢方面的疾病，如苯丙酮尿症、甲基丙二酸尿症等，也可能导致儿童智力发育障碍。
3、单纯的基因突变或染色体异常也可能引起儿童智力发育障碍，如21三体综合征等。
儿童智力发育障碍的患儿应明确病因，如为甲基丙二酸尿症、苯丙酮尿症等代谢病引起的，一定要积极的治疗，经过治疗后，部分患儿可能会取得较好的效果；如为脑损伤、染色体畸形引起的，患儿主要以康复治疗为主。
