目前尚无特效方法可以避免胚胎停育。胚胎停育多是由于胚胎本身存在染色体异常，而无法正常发育所致。这种胚胎自然淘汰机制，也在一定程度上起到了阻止异常胎儿产生的作用，所以也没有必要去预防胚胎停育。

目前，自然怀孕和试管婴儿的胚胎停育发生率相差并不多。因此，如果仅发生过一次胚胎停育，不必要去做试管婴儿。可以适当口服含叶酸的复合维生素，同时积极试孕即可。如果发生了两次或两次以上的胚胎停育，患者需要及时就医，检查是否存在营养素缺乏、凝血功能异常、免疫疾病、感染疾病等情况，尽量明确原因，并进行相应的处理。治愈好原发疾病，也可以在一定程度上降低胚胎停育的风险。